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「京都」は「首都・みやこ」を意味する漢語に由来し、794年の平安京遷都以来の地名である。「府」は明治政府が東京・大阪・京都の三大都市にのみ与えた特別な行政区分で、政治・文化の中心として他の県と区別された。
「京都」は「みやこ（京）の土地（都）」を意味する普通名詞が固有名詞化したもので、794年の平安遷都に始まり平安時代後期に定着した地名。